source: trunk/EventBenchConsole/src/de/ugoe/cs/eventbench/commands/CMDgenerateHybrid.java

Last change on this file was 408, checked in by sherbold, 13 years ago
  • fixed bug in command generateHybrid: sometimes sequences had the wrong length and did not end with the END symbol, even though a valid end was requested.
  • Property svn:mime-type set to text/plain
File size: 5.5 KB
RevLine 
[261]1package de.ugoe.cs.eventbench.commands;
2
3import java.security.InvalidParameterException;
4import java.util.ArrayList;
5import java.util.Collection;
6import java.util.LinkedHashSet;
7import java.util.LinkedList;
8import java.util.List;
9import java.util.Random;
10
11import de.ugoe.cs.eventbench.CommandHelpers;
12import de.ugoe.cs.eventbench.data.Event;
13import de.ugoe.cs.eventbench.data.GlobalDataContainer;
14import de.ugoe.cs.eventbench.models.IStochasticProcess;
15import de.ugoe.cs.util.console.Command;
16import de.ugoe.cs.util.console.Console;
17
18/**
19 * <p>
20 * Command to generate sequences of a given length.
21 * </p>
22 *
23 * @author Steffen Herbold
24 * @version 1.0
25 */
26public class CMDgenerateHybrid implements Command {
27
28        /*
29         * (non-Javadoc)
30         *
31         * @see de.ugoe.cs.util.console.Command#run(java.util.List)
32         */
33        @Override
34        public void run(List<Object> parameters) {
35                String modelname;
36                String sequencesName;
37                int length;
[394]38                int maxLengthAll;
[261]39                int numSequences;
[394]40                boolean validEnd = true;
[261]41                try {
42                        modelname = (String) parameters.get(0);
43                        sequencesName = (String) parameters.get(1);
44                        length = Integer.parseInt((String) parameters.get(2));
[394]45                        maxLengthAll = Integer.parseInt((String) parameters.get(3));
[261]46                        numSequences = Integer.parseInt((String) parameters.get(4));
[394]47                        if (parameters.size() >= 6) {
48                                validEnd = Boolean.parseBoolean((String) parameters.get(5));
49                        }
[261]50                } catch (Exception e) {
51                        throw new InvalidParameterException();
52                }
53
[394]54                if (length <= maxLengthAll) {
55                        // indirectly call command generateFixedLengthSequences
56                        List<Object> parameters2 = new LinkedList<Object>();
57                        parameters2.add(modelname);
58                        parameters2.add(sequencesName);
59                        parameters2.add(Integer.toString(length));
60                        parameters2.add(Integer.toString(length));
61                        parameters2.add(Boolean.toString(false));
62                        parameters2.add(Integer.toString(numSequences));
63                        parameters2.add(Boolean.toString(validEnd));
64                        CMDgenerateFixedLengthSequences cmd = new CMDgenerateFixedLengthSequences();
65                        cmd.run(parameters2);
66                        return;
67                }
68
[261]69                IStochasticProcess model = null;
70                Object dataObject = GlobalDataContainer.getInstance()
71                                .getData(modelname);
72                if (dataObject == null) {
73                        CommandHelpers.objectNotFoundMessage(modelname);
74                        return;
75                } else if (!(dataObject instanceof IStochasticProcess)) {
76                        CommandHelpers.objectNotType(modelname, "IStochasticProcess");
77                        return;
78                }
79                model = (IStochasticProcess) dataObject;
80                Collection<List<? extends Event<?>>> sequences = new LinkedHashSet<List<? extends Event<?>>>();
[394]81
82                List<List<? extends Event<?>>> seqsTmp = new ArrayList<List<? extends Event<?>>>(
83                                model.generateSequences(maxLengthAll + 1, true));
84
85                Console.traceln("" + seqsTmp.size() + " of length " + maxLengthAll
86                                + " possible");
[261]87                List<Double> probabilities = new ArrayList<Double>(seqsTmp.size());
88                double probSum = 0.0;
89                for (List<? extends Event<?>> sequence : seqsTmp) {
90                        double prob = model.getProbability(sequence);
91                        probabilities.add(prob);
92                        probSum += prob;
93                }
[394]94
[261]95                Random r = new Random();
[394]96                int j = 0;
97                while (sequences.size() < numSequences && j <= numSequences * 100) {
[261]98                        j++;
99                        double randVal = r.nextDouble() * probSum;
100                        double sum = 0.0d;
101                        int index = -1;
102                        while (sum < randVal) {
103                                index++;
104                                double currentProb = probabilities.get(index);
105                                sum += currentProb;
106                        }
107                        List<? extends Event<?>> seqTmp = seqsTmp.get(index);
[401]108                        if (!Event.ENDEVENT.equals(seqTmp.get(seqTmp.size() - 1))) {
[394]109                                List<? extends Event<?>> sequence;
110                                if (validEnd) {
111                                        sequence = finishSequence(seqTmp, model, length + 2,
112                                                        validEnd);
[408]113                                        if( sequence!= null && sequence.size()!=length+2 ) {
114                                                sequence = null;
115                                        }
[394]116                                } else {
117                                        sequence = finishSequence(seqTmp, model, length + 1,
118                                                        validEnd);
[408]119                                        if( sequence!= null && sequence.size()!=length+1 ) {
120                                                sequence = null;
121                                        }
[261]122                                }
[408]123                                if( sequence!=null ) {
124                                        sequences.add(sequence);
125                                }
[261]126                        }
127                }
128                if (GlobalDataContainer.getInstance().addData(sequencesName, sequences)) {
129                        CommandHelpers.dataOverwritten(sequencesName);
130                }
131                Console.println("" + sequences.size() + " sequences generated");
132        }
[394]133
134        public List<? extends Event<?>> finishSequence(
135                        List<? extends Event<?>> sequence, IStochasticProcess model,
136                        int maxLength, boolean validEnd) {
[261]137                Random r = new Random();
138                boolean endFound = false;
[394]139                List<Event<?>> sequenceCopy = new LinkedList<Event<?>>(sequence);
[408]140                final int maxIter = 30000;
141                int iter = 0;
142                while (!endFound && iter<maxIter) {
143                        iter++;
[394]144                        sequenceCopy = new LinkedList<Event<?>>(sequence);
[401]145                        while (!endFound && sequenceCopy.size() <= maxLength) {
[394]146                                double randVal = r.nextDouble();
147                                double probSum = 0.0;
148                                for (Event<?> symbol : model.getEvents()) {
149                                        probSum += model.getProbability(sequenceCopy, symbol);
150                                        if (probSum >= randVal) {
[408]151                                                if (!(Event.STARTEVENT.equals(symbol) || (!validEnd && Event.ENDEVENT.equals(symbol)))) {
[394]152                                                        // only add the symbol the sequence if it is not
153                                                        // START
154                                                        // or END
155                                                        sequenceCopy.add(symbol);
156                                                }
[401]157                                                endFound = Event.ENDEVENT.equals(symbol)
[394]158                                                                || (!validEnd && sequenceCopy.size() == maxLength);
159                                                break;
[261]160                                        }
161                                }
162                        }
163                }
[408]164                if( iter==maxIter ) {
165                        return null;
166                }
[261]167                return sequenceCopy;
168        }
169
170        /*
171         * (non-Javadoc)
172         *
173         * @see de.ugoe.cs.util.console.Command#help()
174         */
175        @Override
176        public void help() {
[408]177                Console.println("Usage: generateHybrid <modelname> <sequencesName> <lenght> <maxlengthAll> <numSequences> {<validEnd>}");
[261]178        }
179
180}
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.